Omeka S, sortie en version 1 fin 2017, constitue une refonte complète de Omeka, dit "classique", qui intègre les standards du web sémantique et tient compte des retours des utilisateurs des installations en production de Omeka.

Il conserve toutefois cette situation assez singulière, à la fois un outils de gestion de fonds (bibliothèques, archives, objets, etc.) et un système de publication destinés à faciliter l'accès aux contenus.

Il offre les fonctionnalités suivantes :

• Gestion d'un ensemble important d'items (métadonnées et ressources associées) selon des critères scientifiques et documentaires "à la carte".
• Gestion de sites publics basés sur un choix d'items avec des contenus et des ressources complémentaires.
• Interopérabilité. Les données sont stockées au format json-ld. L'import et l'export sont ainsi facilités et des modules d'échanges sont en cours de développement. Une API est accessible.